医療法人は各都道府県だけでなく、保健所や厚生局にも申請や届出が必要となります。
| 地方厚生（支）局名 | 管轄区域 | 郵便番号 | 所在地 | 電話番号 |
| 北海道厚生局 | 北海道 | 〒060-0808 |
北海道札幌市北区8条西２丁目１番１号 札幌第１合同庁舎８階 |
011-709-2311 |
| 東北厚生局 | 青森県、岩手県、宮城県、秋田県、山形県、福島県 | 〒980-8426 | 宮城県仙台市青葉区花教京院1-1-20 花京院スクエア21F |
022-726-9260 |
| 関東信越厚生局 | 茨城県、栃木県、群馬県、埼玉県、千葉県、東京都、神奈川県、新潟県、山梨県、長野県 | 〒330-9713 |
埼玉県さいたま市中央区新都心１番地1 さいたま新都心合同庁舎１号館7Ｆ |
048-740-0711 |
| 東海北陸厚生局 | 富山県、石川県、岐阜県、静岡県、愛知県、三重県 | 〒461-0011 |
愛知県名古屋市東区白壁1-15-1 名古屋合同庁舎第３号館３階 |
052-971-8831 |
| 近畿厚生局 | 福井県、滋賀県、京都府、大阪府、兵庫県、奈良県、和歌山県 | 〒541-8556 | 大阪府大阪市中央区大手前４丁目１番76号 大阪合同庁舎第４号館３階 | 06-6942-2241 |
| 中国四国厚生局 | 鳥取県、島根県、岡山県、広島県、山口県 | 〒730-0012 | 広島県広島市中区上八丁掘6-30 広島合同庁舎4号館2階市 | 082-223-8181 |
| 四国厚生局 | 徳島県、香川県、愛媛県、高知県 | 〒760-0019 | 香川県高松市サンポート3番33号 高松サンポート合同庁舎4階 | 087-851-9565 |
| 九州厚生局 | 福岡県、佐賀県、長崎県、熊本県、大分県、宮崎県、鹿児島県、沖縄県 | 〒812-0011 | 福岡県福岡市博多区博多駅前3丁目2番8号 住友生命博多ビル4Ｆ | 092-707-1115 |